Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms