Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRHP20396 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRHP20396 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRHP20396 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRHP20396 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRHP20396 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRHP20396 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRHP20396 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRHP20396 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRHP20396 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRHP20396 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRHP20396 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRHP20396 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRHP20396 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRHP20396 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRHP20396 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRHP20396 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRHP20396 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRHP20396 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRHP20396 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRHP20396 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRHP20396 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRHP20396 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRHP20396 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRHP20396 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRHP20396 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRHP20396 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRHP20396 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRHP20396 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRHP20396 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRHP20396 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRHP20396 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRHP20396 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRHP20396 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRHP20396 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRHP20396 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRHP20396 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRHP20396 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRHP20396 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRHP20396 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRHP20396 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRHP20396 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRHP20396 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRHP20396 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TRHP20396 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRHP20396 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRHP20396 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRHP20396 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRHP20396 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRHP20396 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRHP20396 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRHP20396 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TRHP20396 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRHP20396 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRHP20396 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRHP20396 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRHP20396 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRHP20396 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRHP20396 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRHP20396 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRHP20396 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRHP20396 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRHP20396 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TRHP20396 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRHP20396 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
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