Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFAP15692 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms