Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX5BP10606 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COX5BP10606 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX5BP10606 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX5BP10606 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX5BP10606 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX5BP10606 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX5BP10606 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX5BP10606 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX5BP10606 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX5BP10606 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX5BP10606 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX5BP10606 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms