Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RGPD2P0DJD1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms