Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms