Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL3A1P02461 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL3A1P02461 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms