Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSD2O96028 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSD2O96028 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSD2O96028 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSD2O96028 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSD2O96028 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSD2O96028 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSD2O96028 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NSD2O96028 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSD2O96028 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSD2O96028 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSD2O96028 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSD2O96028 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSD2O96028 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSD2O96028 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NSD2O96028 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSD2O96028 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NSD2O96028 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NSD2O96028 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NSD2O96028 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSD2O96028 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD2O96028 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD2O96028 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD2O96028 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD2O96028 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD2O96028 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD2O96028 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD2O96028 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD2O96028 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD2O96028 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms