Protein–RNA interactions for Protein: O76071

CIAO1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIAO1O76071 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIAO1O76071 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIAO1O76071 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms