Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPLO60437 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPLO60437 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPLO60437 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPLO60437 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPLO60437 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPLO60437 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPLO60437 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPLO60437 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPLO60437 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPLO60437 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPLO60437 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPLO60437 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPLO60437 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPLO60437 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPLO60437 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPLO60437 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPLO60437 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPLO60437 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PPLO60437 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPLO60437 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPLO60437 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPLO60437 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPLO60437 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms