Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYTH3O43739 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms