Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DENRO43583 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DENRO43583 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DENRO43583 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms