Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBDO15205 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBDO15205 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBDO15205 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms