Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP290O15078 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP290O15078 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP290O15078 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP290O15078 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP290O15078 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP290O15078 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP290O15078 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP290O15078 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP290O15078 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP290O15078 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP290O15078 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP290O15078 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP290O15078 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP290O15078 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP290O15078 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP290O15078 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP290O15078 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP290O15078 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP290O15078 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP290O15078 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP290O15078 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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