Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2SURPO15042 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2SURPO15042 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms