Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIK3C2AO00443 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3C2AO00443 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms