Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms