Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms