Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms