Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPED1A4D0V7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPED1A4D0V7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms