Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF5Q9Y2D1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF5Q9Y2D1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF5Q9Y2D1 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF5Q9Y2D1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF5Q9Y2D1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF5Q9Y2D1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF5Q9Y2D1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF5Q9Y2D1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF5Q9Y2D1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF5Q9Y2D1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF5Q9Y2D1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF5Q9Y2D1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF5Q9Y2D1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF5Q9Y2D1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF5Q9Y2D1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms