Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABCG2Q9UNQ0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms