Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN1Q9ULB1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms