Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI9

POU2F3, POU domain, class 2, transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU2F3Q9UKI9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POU2F3Q9UKI9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU2F3Q9UKI9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms