Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSKSQ9UJT2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms