Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1L1Q9UHC9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms