Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms