Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
CCDC180Q9P1Z9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms