Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms