Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP1Q9NZU7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP1Q9NZU7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP1Q9NZU7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP1Q9NZU7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP1Q9NZU7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP1Q9NZU7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP1Q9NZU7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP1Q9NZU7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP1Q9NZU7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP1Q9NZU7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP1Q9NZU7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms