Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms