Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GINM1Q9NU53 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms