Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG3Q9NT62 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms