Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMSN1Q9NSI8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms