Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SALL1Q9NSC2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms