Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms