Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms