Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms