Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GOPCQ9HD26 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOPCQ9HD26 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms