Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YTHDC2Q9H6S0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms