Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00597Q9H2U6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms