Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RSPH6AQ9H0K4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms