Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BCL11BQ9C0K0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCL11BQ9C0K0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms