Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms