Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms