Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms