Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHCHD7Q9BUK0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHCHD7Q9BUK0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHCHD7Q9BUK0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHCHD7Q9BUK0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHCHD7Q9BUK0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHCHD7Q9BUK0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHCHD7Q9BUK0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHCHD7Q9BUK0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHCHD7Q9BUK0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHCHD7Q9BUK0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHCHD7Q9BUK0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHCHD7Q9BUK0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHCHD7Q9BUK0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHCHD7Q9BUK0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CHCHD7Q9BUK0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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