Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms