Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBF4Q9BQW3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBF4Q9BQW3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms