Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TUBA1CQ9BQE3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TUBA1CQ9BQE3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms